Jackson Guitars werden in Japan, USA, Mexiko und Indien hergestellt. Die Modelle werden mit unterschiedlichen Setups und entsprechenden Preiskategorien angeboten. Ausschlaggebend ist dabei das verwendete Holz, das Halsprofil oder die Mensur, das Herstellungsland oder auch Details wie Verzierungen.
Alle Instrumente mit durchgehendem Hals aus der Pro Series kommen beispielsweise aus Indonesien. Die Dinkys aus der Pro Series, die allesamt über einen geschraubten Hals verfügen, werden in einer neu eingerichteten Abteilung im Fender-Werk in Ensenada/Mexiko hergestellt.
Jackson Guitars ist in der Werkstatt von Wayne Charvel und Grover Jackson in Kalifornien entstanden – ebenso wie Charvel Guitars gehört Jackson seit 2002 zu Fender. Bis 1986 wurden Jackson und Charvel Gitarren in Kalifornien produziert. Der erste Erfolgsschlager war die Superstrat. Aufgrund der steigenden Nachfragen lagerte man die Produktion nach Japan aus.
1989 verkauften die beiden Gründer Wayne Charvel und Grover Jackson ihre Marken an den japanischen Hersteller IMC (International Music Corporation). Mit der Übernahme von Fender 2002 wurde Jackson Guitars wieder in den USA produziert und erlebte eine Renaissance – und Fender tauchte in die Metal-Szene ein.